1、生活水域不同。生活水域在超过200米深度的鱼称之为深海鱼。而浅海鱼是生活于接近海面上200米深度以内的鱼类；

2、生长周期不同。生活于深海的鱼类，通常所处的海水温度低。接近南北极的水域，温度会更低。所以，深海鱼相比较于浅海鱼，大多都是生长周期比较长，生长较为缓慢；

3、营养价值不同。在营养价值方面，两者都含有大量的脂肪、蛋白质、矿物质、维生素，但是深海鱼所含有的营养物质更丰富，尤其在矿物质和不饱和脂肪酸方面；

4、数量减少速度不同。深海鱼类由于生存的空间中竞争小，远离人类活动范围，浅海鱼类竞争激烈，接近人类，淡水鱼数目减少更快等。