马丁·路德的主要思想如下：

1、因信称义，信徒可以由于信仰而直接成为义人。

2、信徒拥有自我理解《圣经》的权利，反对罗马教廷的说教。

3、《圣经》具有最高权威，反对教皇的最高权威。

4、简化宗教仪式，革除天主教的繁文缛节。

5、教会的组织形式与个人的得救无关，故主教制，长老制和公理制都可采用。

加尔文的主要思想如下：

1、先定论，即认为上帝在创世以前，预先选定一些人得救，决定另一些人沉沦，这是加尔文神学体系的基石。