扇贝主要食物为有机碎屑、悬浮在海水中的微型颗粒和浮游生物，如硅藻类、双鞭毛藻类、桡足类等，其次还有藻类的孢子、细菌，其食物种类组成与环境中的种类相一致。扇贝为滤食性动物，对食物的大小有选择能力，但对种类无选择能力。大小合适的食物随纤毛的摆动送入口中，不合适的颗粒由足的腹沟排出体外。其摄食量与滤水速度有关，滤水速度在夜间1－3点为最低值，因此摄食量在夜间最大。