清除锦鲤寄生虫方法如下：

1、每天换水3分之1，然后使用专用杀菌剂二氧化氯、高聚碘等杀菌。

2、当有明显的变化时，一个星期后再杀虫一次。 还可用浓度为百万分之0.05的孔雀石绿溶液或者是百万分之2的亚甲基蓝溶液对锦鲤鱼体进行药浴，同时将水温环境提升到25摄氏度以上。

寄生虫的种类有很多种，每一种的治疗方法不尽相同。但是每种寄生虫对锦鲤的危害是差不多的，寄生虫如果不及时治疗就会导致其他的锦鲤鱼被传染。所以寄生虫的预防是很重要的。