对方代垫运费应作分录：

借：材料采购。贷：其他应付款 其他应付款科目核算企业发生的应付，暂收其他单位或个人的款项。具体包括：应付经营租入固定资产和包装物租金；职工未按期领取的工资；存入保证金如收取的包装物押金等；应付，暂收所属单位，个人的款项如应付统筹退休金等；其他应付，暂收款项。该科目应按应付，暂收款项的类别和单位或个人设置明细账，进行明细分类核算。