松果体能感受光的信号并作出反应。例如人们在阳光明媚的日子里会感到心情舒畅、精力充沛、睡眠减少。反之，遇到细雨连绵的阴霾天气则会情绪低沉、郁郁寡欢、常思睡眠。

松果体是人体的“生物钟”的调控中心。由于褪黑激素的分泌受光照和黑暗的调节，因此，昼夜周期中光照与黑暗的周期性交替就会引起褪黑激素的分泌量相应地出现昼夜周期性变化。

松果体分泌褪黑激素能够影响和干预人类的许多神经活动，如睡眠与觉醒、情绪、智力等。

松果体能合成GnRH、TRH及氨酸催产素等肽类激素。