野生蘑菇可以采取孢子分离或者组织分离获得菌丝体。

菌丝是真菌的一种管状单条的丝状结构，也是不相关的放线菌门的一种结构。它是大多数真菌的结构单位，而部分原核生物也有菌丝。菌丝一般分为两类，有隔菌丝和无隔菌丝。在大多数真菌中，菌丝是营养生长的主要模式，并且被统称为菌丝体；酵母是单细胞真菌不成长为菌丝。