华西医科大学有临床医学院、基础医学与法医学院、药学院和口腔医学院，各院的专业：

1、临床医学院，专业有药剂学、内科学、外科学、护理学、肿瘤学、临床检验诊断学、妇产科学、麻醉学、病理学与病理生理学、皮肤病与性病学、神经病学、生理学、眼科学、影像医学、核医学、运动医学、儿科学、中西医结合临床、精神病与精神卫生学、康复医学与理疗学、老年医学、遗传学、急诊医学、耳鼻咽喉科学、循证医学、临床药物与器械评价科学、移植科学与工程学；

2、基础医学与法医学院的专业，专业有药理学、生物医学工程、法医学、生物化学与分子生物学、病理学与病理生理学、生理学、人体解剖与组织胚胎学、免疫学和病原生物学；

3、药学院，专业有药事管理学、药物化学、药剂学、药理学、药物分析学、生药学、微生物与生化药学和临床药学；

4、口腔医学院，专业有口腔临床医学和口腔基础医学。