酶催化的化学反应不一定都要消耗ATP，例如人的消化道中蛋白质水解成多肽及氨基酸的过程中只需要酶的催化而不需要消耗ATP，但有的化学反应在酶的催化作用下进行也是需要能量的。大多数水解酶单纯由蛋白质组成，黄素单核苷酸酶则由酶蛋白和辅助因子组成，结合酶中的酶蛋白为蛋白质部分，辅助因子为非蛋白质部分，只有两者结合成全酶才具有催化活性。