首先，财务工作人员要对房产的销售收入进行清理并编制表格。如果是全部都已销售并开具发票的还好计算，那计入土增清算的收入就是主营业务收入-房屋销售收入。如果只是部分已销售并开具发票的，那么就要清理那没有开发票房屋，哪些是自用或出租的，这部分是不用缴土地增值税的；除了自用或出租的房屋，还有一些未开具发票的房屋，有哪些是视同销售的也要征缴土增税，比如有可能是用来抵债了。

清理完收入以后，就要对可以扣除的项目进行清理。为了便于后期填制土地增值税申报表，可以把扣除的项目按以下六大类来进行分类并编制表格：1、前期工程费2、建筑安装工程费3、基础设施建设费4、公共配套费5、开发间接费6、利息费用这六大类的成本费用，都必须有发票才能进入扣除项目，如果没有发票是不能进入扣除项目的。有的房地产企业有多个项目，有些成本费用是共用的，怎么分配呢？小编整理了下分配的方法。

把收入和可扣除项目清理好后，就要开始找证据了，证明自己提供的数据真实可靠，比如收入类，如果有些是用来出租的，不用算入土地增值税收入，那么就要提供出租合同和发票。准备税务局要求的各种资料，税务局要求你进行土增清算时就会给你一套要提供的资料清单，按清单上准备资料就可以了。

把数据和资料准备好以后，就可以进行填制土增清算的表了，一般税务局要求4月30日以前提交申请表，纸制版和电子版。5月1日-9月30日是税务局审核和稽查的时间。这个时间要看各地区税务局的安排，会有不同。