基因组测序只能测出整个DNA的碱基对排列顺序，不能直接测出DNA上的基因及其功能，必须通过生物信息学方法，结合蛋白组学、转录组学，对测出来的序列进行分析，将基因及其功能加以挖掘、注释，这称作基因注释。

快速有效的基因注释对进一步识别基因，研究基因的表达调控机制， 研究基因在生物体代谢途径中的地位，分析基因、基因产物之间 的相互作用关系，预测和发现蛋白质功能，揭示生命的起源和进 化等具有重要的意义。