无论是光木耳和毛木耳，为了能长时间保存，采摘后的鲜品须马上干制。干制木耳一般采用阳光曝晒的方法，鲜品晒干大致一到三天。晒干后的木耳，如用塑料农膜包裹，可存放两年以上不会霉变。即使自然存放于干燥的室内不包裹的话，木耳干制品一般数月也不会坏掉。泡发干木耳最重要的是要用冷水。温热水泡后的木耳不仅不易充分发开，口感还会绵软发黏，不少营养成分也都被溶解掉了。如果一次吃不完，只要每天用冷水淘洗一遍，一般放上3—5天都不会变质。另外，黑木耳容易粘泥沙，可用盐水清洗，轻轻揉匀，待水变浑，再用清水淘洗即可。