农村合作医疗和社保的区别包括以下几点：1、合作医疗只能农民才可以参加；2、合作医疗必须以家庭为单位整户参加；3、合作医疗是一年一交费，一年一参合，参合本年度享受报销；4、合作医疗基金筹措有限，保障力度低；5、合作医疗为国家的政策，以解决参合农民因病致贫、因病返贫为最终目的。【法律依据】《社会保险法》第二十九条，参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。