协议离婚的主管机关，在城市是市辖区、不设区的市人民政府的民政部门；在农村是乡、民族乡、镇的人民政府。

在婚姻登记机关中，由持有婚姻登记管理员证书的人员从事协议离婚的登记工作。

协议离婚的程序流程：

1）当事人申请

离婚是一种重要的身份法律行为，当事人离婚，必须双方亲自到婚姻登记机关申请离婚登记，不得委托他人代为办理；协议离婚的，应到一方户口所在地的婚姻登记机关申请离婚登记；

2）婚姻登记机关审查

婚姻登记机关应对当事人的离婚申请进行审查，查明当事人所携带的证明和证件是否齐全，当事人是否符合登记离婚的条件；符合条件的，当场予以登记，发给离婚证。

法律依据：

《婚姻法》第三十一条

男女双方自愿离婚的，准予离婚。双方必须到婚姻登记机关申请离婚。婚姻登记机关查明双方确实是自愿并对子女和财产问题已有适当处理时，发给离婚证。