黄曲霉菌很难杀死，耐高温，其中黄曲霉毒素b1的分解温度为268摄氏度，紫外线对低浓度黄曲霉毒素有一定的破坏性，巴氏消毒法或烘烤面包的热度可以基本消灭。

黄曲霉菌在发霉的、淀粉含量高的食物里广泛存在，其容易在高温湿润的环境下滋生，如玉米、豆类等食物。变苦的瓜子、杏仁等坚果中也含有黄曲霉素，食用过量会增加患肝癌的风险。久泡的木耳也可能有黄曲霉菌。木质筷子不容易被清洗干净，长时间也容易导致霉变而产生黄曲霉菌。变质发霉的食物应该直接扔掉，不要不舍得扔，普通的烹饪手段是无法完全杀死黄曲霉菌的。