青海湖盛产青海裸鲤，也就是湟鱼。由于青海湖渔业的大规模开发，捕捞强度过大，湟鱼数量不断减少，呈逐年下降趋势。1982年后青海政府采取封湖育鱼的措施，限制青海湖渔业的过度捕捞，意在恢复湟鱼的生态平衡。

2004年，《中国物种红色名录》将湟鱼列为濒危物种。

青海湖是中国最大的咸水湖，是国家珍贵的保护湿地资源之一，这里的鸟类资源多达222种。

青海湖鱼鸟共生的生态系统，“水―鸟―鱼”缺一不可，湟鱼资源的削减同时对青海湖鸟类的生存产生着巨大的威胁。