1、转基因玉米个头过大，普通玉米个头偏小。2、普通玉米颜色较统一，转基因玉米颜色多样。3、5月和10月是普通玉米的收获季节，若是反季，多数为转基因玉米。4、普通玉米多被害虫侵袭，转基因玉米很少。

1986年，Fromm等人首次成功将转基因技术应用在玉米上, 将目的基因转入到玉米原生质体中。

转基因玉米和普通玉米相比，在产量、营养含量、口感、外形等方面更具有可控性。相比之下，转基因玉米产生了新的生物学性状。

转基因玉米颜色深浅相当，整个玉米的色泽统一，而普通玉米上面的玉米颗粒是有深浅变化的，色泽不一致。