水母为肉食性，以浮游生物，小的甲壳类、多毛类甚至小的鱼类为食。水母会由于食物的机械刺激和化学刺激而伸长触手，放出刺丝囊以缠绕、麻痹、毒杀捕获食物，再将食物送入口中。水母口区腺细胞分泌的粘液有利于食物的吞咽，水母将食物吞入胃腔后才杀死及消化。

食物进入水母胃腔，胃层的腺细胞开始分泌蛋白酶，分解、消化食物使之形成许多多肽，同时胃腔的营养肌肉细胞的鞭毛运动可以混合和推动食物。

营养肌肉细胞的伪足吞噬食物颗粒，在细胞内形成大量食物泡，经酸性及碱性的化学过程后，营养物质通过各种管道输送到全身，未消化的食物残渣仍由口排出。