东台吉乃尔湖和西台吉乃尔湖的区别主要包括三个。区别一：地理位置不同。区别二：两个湖的长、宽、面积大小、水深、湖面海拔不同。区别三：湖内固体盐类矿物不同。

东台吉乃尔湖，位于青海省海西蒙古族藏族自治州格尔木市境内，地处东经93°49′-94°01′，北纬37°24′-37°36′之间。

西台吉乃尔湖，位于青海省海西蒙古族藏族自治州大柴旦镇境内，地处东经93°16′-93°29′，北纬37°39′-37°47′之间。

东台吉乃尔湖呈北西-南东向分布，长22公里，宽5公里，面积约116平方公里，水深0.6-1.0米，湖面海拔2681米。