虹桥火车站可从南进也可从北进。旅客可通过南北高架平台、各条公交线路直接进站，地下可从交通换乘大厅乘坐自动扶梯进入候车厅。检票口主要分列在候车大厅两侧，检票口上方的电子屏幕显示车次名称和开车时间，旅客可根据车票的信息选择相应的检票口就近候车。

虹桥火车站的出站口设在站台两端，分别标有“出站(北)”、“出站(南)”的字样。旅客到站后可遵循就近原则，选择距离自己更近的一侧进出站。

车站的地下一层设置有换乘通道，位于站台正下方，两侧分布出站检票口。换乘通道往东可到达虹桥机场T2航站楼和东交通中心，向西通往长途汽车站、地下车库和西交通中心。