福州南站和北站都是动车站。福州北站原为福州站，站点评级为一等站，是中国规模较大的区域交通枢纽之一，福州南站是2010年投入使用的车站，评级为一等站，是按动车站规划建设的。

福州北站可通过福州地铁1号线直达，北广场设置有停车场，站内设置有旅客引导系统，可以自主查询列车信息。

福州南站可通过福州地铁1号线直达，开通有专门的换乘通道，换乘不需要再次进出站和验票。