蝇香有轻微的毒性，对人体具有一定的危害。蝇香里面含有菊酯类的有机化合物，这种物质对人体有害，使用蝇香时，最好不要与人处在同一室内，可以在睡前两小时使用，睡觉时开着纱窗通风。

蝇香和蚊香的成份不一样，燃烧的烟当中产生的有害气体也不同，其燃烧的烟中含有超细微粒，这种颗粒物质如果被人体吸入，容易影响人的呼吸道。

蝇香里的有效成分含有农药，虽然浓度较低，但从理论上来说，还是有毒性的，购买时最好买正规产品，严格按照说明使用，以免影响人体健康。