商行和便利店的区别主要在于规模不一样。商行的规模一般都是比较大的，商行一般主营高档烟酒，售卖的货品较多店铺面积大，便利店售卖的货品大部分是日用品与食物，店铺面积不大，规模相对于商行会比较小。

商行的另一个意思是指商业行会，是一个由从事同样商业的同行组成的民间协会组织，主要职能是制定行业规范、解决行业纠纷等。

商行与便利店在形式上的区别是，商行能以企业的形式由公司进行登记注册，也能以个体工商户的形式由个人进行登记注册，便利店只能是以个体工商户的形式由个人登记注册。