飞机上的厕所粪便由真空产生的高压气流送到飞机的存储箱内储存，等到飞机着陆后，由地勤人员回收处理。保存在储存箱内的粪便一般会通过具有除臭和分解作用的化学物质进行处理。

飞机存储箱的开关阀门位于机身外部，飞机着陆后，地勤人员会将一根软管接到阀门处，将排泄物回收到处理车上，并送到指定地点处理。

飞机上产生的废水通过机身的排水口进行排放，由于海拔足够高，这些水一般会在气流的作用下分解掉，不会造成影响。

在飞机上使用厕所的时候注意按照厕所内的提示操作，起身后将马桶盖子盖上再冲水，以免人体被巨大的真空吸力吸住。