蜂箱里面长棉虫应该及时去除并加以预防。去除棉虫方法多样，最主要的还是对于棉虫的彻底清除，才不会让蜂农承受棉虫所带来的损失。

首先需要蜂农平时多清扫峰箱底层，然后去除陈老破旧的巢脾，再把长了棉虫的那一块蜂巢去除掉，整片都割下来，及时销毁。只能留下好的蜂巢，否则还是会留下棉虫生长的可能性。

其次是将受棉虫害的蜂巢、蜜蜂等其他有关的一切从蜂箱中移除，在距离蜂箱3公里左右进行隔离治疗。将消毒干净的蜂箱放在受虫害的蜜蜂中，并在箱内放入几张空脾，将病蜂抖落在在上面，找到蜂王杀死，再重新寻找一只新蜂王，最后对病蜂进行药物治疗。

对于棉虫害，蜂农们应该提前采取防治措施，等到发现棉虫时有应对措施。预防棉虫，最重要的是保证峰箱的完整性，峰箱没有缝隙，就不会有有蜂屑可以进入裂缝，从而就不会给棉虫有产卵的机会。