1、成分不同。伴生矿也就是伴随着玉石共同产生的矿石，虽然外观比较类似，但它们的成分却是不同的，伴生矿的主要成分是二氧化硅，属于石英的一种，不含铜、铁、锌等微量元素，而绿松石内含有多种矿物质，是铜和铝的碳酸盐矿物集合体。

2、稳定性不同。伴生矿虽然是和玉石伴随着产生，但它们的稳定性是不同的，伴生矿过水不会变色，甚至部分伴生矿看着瓷度不错，遇水会破裂，而对比而言绿松石的内部结构化学性质要稳定很多，这也是它们的最大区别之一。

3、颜色不同。绿松石的颜色气质和伴生矿的颜色不同的，虽然有一些相似，但大部分的伴生矿可通过肉眼观察区分，比如说一些紫色伴生矿、牛角石伴生矿、柠檬黄伴生矿、石英伴生矿等，而绿松石的颜色有天蓝、淡蓝、蓝绿、绿、浅绿、黄绿、灰绿等颜色。