1、是否收费不同，微信收款商业版在自动结算时会收取手续费，行业不同，费率也不同，一般是0.6%，即一天收入1000元，需要缴纳6元手续费，实际到账994元。而个人版收款小账本的使用则是完全免费的，收到的钱直接进入微信钱包。

2、目的用处不同，微信收款商业版针对于线下门店，以门店为核心，提供丰富的经营与营销功能。个人版的收款小账本针对于用个人二维码收款的小商贩，以个人为核心，提供基础的经营与营销功能。

3、涵盖功能不同，个人版的功能都被商业版涵盖了，并且商业版有许多「小账本」没有的功能。商业版的主要功能有收款记录、支持信用卡付款、自动提现、多门店/多店员管理、官方营销活动、手机扫码付款、免费官方物料、收款语音播报、经营报表分析、商品货架、积分会员。