胚胎着床失败。胚胎着床失败在辅助生殖技术中并不罕见，甚至是经历了多个IVF周期，并且移植了多枚优质胚胎仍出现妊娠失败。胚胎着床是处于活化状态的胚泡与处于接受状态的子宫相互作用，导致胚胎滋养层与子宫内膜建立紧密联系的过程。着床失败是胚胎与子宫内膜在建立紧密联系过程之前的某个环节发生异常，导致胚胎未能着床。

早期自然流产。IVF中的早期自然流产包括生化妊娠和临床妊娠的自然流产。生化妊娠是指胚胎滋养外胚层已侵入子宫蜕膜层，胚胎分泌的β-hCG进入母体血液循环并达到可检测的水平，之后因某种原因妊娠没有继续，超声检测未见孕囊，是早期流产的特殊类型，而临床妊娠是超声能够检测出孕囊的妊娠阶段。目前，胚胎染色体异常是公认导致IVF早期流产的最常见因素，早期流产中有50%～60%与胚胎染色体缺陷有关，流产的孕周越早，染色体异常所占的比例越大。大数据分析表明，40岁以上女性自然流产率高达25%以上，45岁以上女性甚至超过50%；而赠卵IVF的流产率及活产率与受者女性年龄无相关性，进一步提示对于高龄女性，流产率增高多数是因为胚胎非整倍体发生率增加所致。