1、水中微生物与水的营养度有关，水中越多适合微生物生长的元素就会加快微生物生长，举例最常见的就是磷。控制水质的营养度即可控制微生物的数量。光照、温度等也会影响。

2、最主要的仍然是水的营养度。此外，强光照（杀菌）和低温（控制微生物的繁殖）都可控制微生物。