1、经济原因：财政税务危机，士绅阶层获得利益过多，排斥商业发展，土地兼并现象日趋严重，作为明朝经济主体的小农经济孤立而脆弱。

2、政治原因：士绅。文官阶层作为既得利益集团，已无力推动变革；政治上长期被压制的武官在镇压民乱的过程中逐渐军阀化，中央对其统治力不断下降。

3、自然原因：气候危机，连年大面积灾害，冲击了脆弱的小农经济。