1、益生元可以在体内促进肠道有益菌的生长和繁殖，形成微生态竞争优势，优化肠道微生态平衡，进而提高免疫力，以保持机体健康。

2、同时，又能够改善肠道微生态，例如：低聚糖类物质能够促进肠道有益菌双歧杆菌及乳酸杆菌的大量增殖， 同时有益菌代谢产生的短链脂肪酸和一些抗菌物质可直接抑制外源性致病菌和肠腐败菌如拟杆菌属、梭菌属和大肠埃希菌类的生长繁殖。