1、不续签的理由是工作不能胜任，或者该部门要被取消，根据《劳动合同法》第46条的规定可以看出，如果员工不续签劳动合同，公司是否补偿需分两种情况对待：若用人单位降低原来劳动条件，员工不续签的，则单位对员工还要进行经济补偿。

2、若用人单位已经维持或者提高了原来劳动条件，员工仍然不续签的，则单位不对员工不进行经济补偿。