1、方阵朝向受建筑物支配。

2、由于靠近屋顶，光伏组件运行起来温度更高因此效率更低)。

3、方阵容量受制于可用面积。

4、屋顶需要翻新时，方阵也需要移走开始时屋顶处于良好状态，所以这种情况在15年以后才会发生)。

5、方阵可能不太容易靠近，这种情况下就无法清除方阵上面的冰雪。

6、穿透屋顶在屋顶固定方阵时需要打孔)可能导致屋顶渗漏。