1、扣费方式不同。etc记账卡车辆在通过高速公路收费站时，系统根据通行记录在账户中扣除当次通行费。而储值卡是系统直接从卡内扣除当次通行费。

2、预存通行费的方式不同。etc记账卡要求用户需在后台账户预存通行费，而储值卡是用户需在卡内预存通行费，如果储值卡内没有钱就不能通过高速收费站。