1、豆仁颜色不同。其实，只要咬开里边的豆仁就能清楚的知道谁是谁了。黑豆的豆仁是黄色的，而黑芸豆咬开之后，里边的豆仁是白色的，有的还白中带青黑色。

2、形状不同。相比较两者，黑豆会比黑芸豆大，而且大部分黑豆是圆的，黑芸豆则是扁的和椭圆的。

3、类别与营养价值不同。黑豆属于大豆类，和黄豆一样可以补充人体所需的钙、铁等多种营养物质；而黑芸豆它的豆粒会比黑豆小，是属于淀粉豆类，含有蛋白质、碳水化合物等多种维生素，但营养价值还是不及没黑豆。

4、产地不同。黑豆是中国的原生豆，而黑芸豆原产是美洲的墨西哥和阿根廷，我国在16世纪末才开始引种栽培的。

5、价格不同。黑芸豆营养价值等各方面都不如黑豆，价格自然也就比黑豆的便宜。