呼伦贝尔下辖13县级行政区即旗(包括自治旗)、县级市和市辖区，具体如下：

1、7个旗，即4个旗和3个自治旗：阿荣旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗和陈巴尔虎旗；莫力达瓦达斡尔族自治旗、鄂伦春自治旗和鄂温克族自治旗。

2、5个县级市：满洲里、扎兰屯、牙克石、根河和额尔古纳市。

3、市辖区：海拉尔区（以前为县级“海拉尔市”）。