化学变化中的最小微粒永远是原子。譬如，置换反应：铁与硫酸铜反应生成硫化铁和铜，其中，铁、铜就是以原子形式来参加反应的。化学是研究物质变化的物理是研究物质特性的两者有些许区别，虽然化学过去也是物理的一个分支。 离子是原子的另一种表现形式，不是物质的组成结构的一部分，不算是结构微粒。