乳房生物反应器的主要原理是先应用重组DNA技术、转基因技术将目的基因转移到尚未分化的动物胚胎细胞(或受精卵)中，再应用胚胎移植得到能在乳腺中表达转基因产品的个体，使个体能够分泌“目的产品”如具有药用价值的蛋白的乳汁，最后在回收的含转基因蛋白的动物奶中提取有重要药用价值的生物活性蛋白。