公寓和商业房有房产证。

公寓是有房产证的。公寓是属于旅馆建筑的，土地的使用分类为商服用地，房屋的用途一般为旅（宾）馆，酒店式公寓的产权土地的使用年限一般为40年。同时，公寓式酒店的特殊性也是在于一般会按照公寓式或者是单元式房型进行设计建造的，但是其本质上仍是酒店，也是不属于住宅的，按照相关的规定也是不得分套销售的。

商业房是具有房产证的，商业房产证和居住房产证是没有本质上的区别以及限制的，只是在规划土地用途一栏有区别，商业房写的是商业，住宅房写的是住宅。但是商业房产证在办理和转让过程中的税费相对较高，具体高多少要看当地政策。还有一个比较大的区别，就是商业房产的土地使用年限较普通住宅有较大的差距。原则上，普通住宅是70年，商用住宅使用年限是40年。