荷花地下茎横生于泥中，成圆至椭圆形，节上生不定根和侧芽，节间肥大，其中具多条气腔。茎上还有许多细小的运水导管，导管壁上附有增厚的黏液状木质纤维素，具有弹性。在叶柄、花柄上也有气腔，运水导管和木质纤维素，具与地下茎联通。藕的顶端具顶芽，萌发后抽出白嫩细长具节的藕鞭，鞭的末端长出新藕，称为主藕，一次分枝称子藕，二次分枝称孙藕。叶分三种，种藕最初长出的叶称钱叶，最早从藕鞭节上长出的几片枝称浮叶，继而长出挺水叶，为立叶，三种叶在出水前均对折卷成双筒状紧贴叶柄，统称卷叶，叶近圆形，盾状全缘，叶表具角质，乳头状突起，花单生，两性，萼片绿，多早落。花蕾桃形，色暗紫、玫瑰红或灰绿。花型有单瓣、复瓣、重瓣、重台、千瓣。雌雄蕊全部瓣等。花色有红、粉、白、淡绿、黄、复色、间色之分。