1、牡丹籽油的主要脂肪酸为亚麻酸，含量为百分之四十五左右，其次为亚油酸和油酸，分别占百分之二十五，百分之二十二，而亚麻籽油的主要脂肪酸为亚麻酸，含量为百分之五十五，油酸以及亚油酸分别占百分之二十，百分之十六。

2、牡丹籽油及亚麻籽油均以生育酚为主，牡丹籽油生育酚含量为八百二十三点六一至九百六十三点一七毫克每千克，而亚麻籽油的仅为四百八十七点七五毫克每千克。

牡丹籽油：

牡丹籽油，又称牡丹油，是由牡丹籽提取的木本坚果植物油，以牡丹籽仁为原料，经压榨（或亚临界生物技术）、毛油过滤、脱色、脱臭、脱蜡、精密过滤等工艺制成。特征指标包括光指数、相对密度、碘值、脂肪酸组成等4个指标；质量等级指标分为一级、二级成品油质量指标，指标包括色泽、气味、滋味、透明度、水分及挥发物、不溶性杂质、过氧化值、溶剂残留量。2013年9月，由菏泽与菏泽牡丹产业化龙头企业立项制定的《牡丹籽油》行业标准首次对牡丹籽油的技术要求、生产流程、检验方法等方面进行了量化规范，为今后牡丹籽油的生产树立了标杆。2014年11月26日，牡丹籽油行业标准在菏泽首次全国发布，规定其α亚麻酸含量不低于38%。《牡丹籽油》标准全面规范了牡丹籽油的技术要求、生产流程、检验方法等各项指标。如标准中的技术要求包括特征指标、质量等级指标、卫生指标及其他。