一般分为经穴、经外奇穴和阿是穴、耳穴四类：

1、经穴：又称十四经穴，是十二经脉和任脉、督脉循行路线上的腧穴，是全身腧穴的主要部分，计361个。

2、经外奇穴：凡未归属于十四经脉、定位明确、有特定疗效的腧穴，称为奇穴。

3、阿是穴：是病症在体表上的反应点，无固定部位，往往随病而起，病愈即失。

4、耳穴：是病症在耳廓上的反应点，其分布呈倒置胎儿状。各腧穴虽经分类，但它们之间又有联系。不少奇穴位于十四经脉上，以后有归属于经穴的。不少阿是穴经过反复实践，确定其部位和主治作用，加以命名者，又成为奇穴。因此，腧穴的分类在历史发展过程中并不是绝对的，它们相互补充，不断发展，形成腧穴的体系。