清平县汉置贝丘县，北齐省。隋初复置，开皇十六年改为清平县，属清河郡，故治在今临清市城东20公里水城屯村。

宋元丰四年因漯河决城毁，治所迁至明灵寨即今高唐县清平镇。明、清皆属东昌府。民国年间，先后属济西道、东临道、德临道。1946年8月，为纪念在抗日战争中牺牲的冀南行署第七分区政委肖永智，曾改名永智县。1949年8月恢复清平县，属平原省聊城专区。1952年平原省撤销，划归山东省聊城专区，同年县政府迁至今临清市康庄镇。1956年清平县建制撤销。其辖区分别划归临清县和高唐县。