原因是多方面的，最主要是军事上的失误。首先是经过明太祖朱元璋的铁血清洗，明初的一些善于带兵的将领大多已经不在了。没有好的将领，再多的兵也是枉然。也有军事部署的问题，造成都城南京兵力空虚，犯了兵家大忌。给了朱元璋长途奔袭，一举定乾坤的机会。而且建文帝本身过于懦弱和他的叔父朱棣相比还太嫩，最终占据绝对的优势而最后失败。朱允炆在安定的生活中成长，接受的是儒家学说的熏陶，缺少对现实的了解，而且他所重用的大臣也多是读书人，因此改革中难免有理想主义色彩。