厌氧菌是一类在无氧条件下比在有氧环境中生长好的细菌，而不能在空气或二氧化碳浓度下的固体培养基表面生长的细菌。这类细菌缺乏完整的代谢酶体系，其能量代谢以无氧发酵的方式进行。它能引起人体不同部位的感染，包括阑尾炎、胆囊炎、中耳炎、口腔感染、心内膜炎、子宫内膜炎、脑脓肿、心肌坏死、骨髓炎、腹膜炎、脓胸、输卵管炎、脓毒性关节炎、肝脓肿、鼻窦炎、肠道手术或创伤后伤口感染、盆腔炎以及菌血症等。

根据对氧气的耐受程度，厌氧菌分为三类。分别是对氧极端敏感的厌氧菌月形单胞菌，中度厌氧菌脆弱拟杆菌，耐氧厌氧菌溶组织梭菌。