马山县位于广西中南部，隶属广西首府南宁市。东交上林、忻城县，南邻武鸣县，西接大化、平果县，北隔红水河与都安瑶族自治县相望，是南宁市的北大门。

马山被称为全国"水电资源富矿"的红水河，流经本县境内近100公里。我国重点开发红水河10座大型梯级水电站中，百龙滩水电站就在本县境内，距离县城15公里。