市级审计局是正处级单位，由市长直接分管；区县级审计局是正科级单位，由区长、县长直接分管。地方各级审计局均为行政单位，国家公务员编制。审计局主要负责地方政府各部门和所有企事业单位的审计监督工作。审计局一般设有办公室、财政金融审计科、行政事业审计科、经贸审计科、固定资产投资审计科、农业资源与环境审计科、干审科、干部经济责任审计办公室、内审协会等科室。