两者各有千秋。

1、剧情上，美国末日讲述了人类因现代传染病而面临绝种危机，当环境从废墟的都市再度自然化时，幸存的人类为了生存而自相残杀的故事。整其个游戏里的一切都是为剧情服务的。神秘海域走的是印第安纳琼斯的寻宝路线，剧情性相对较差。

2、画面上，神秘海域更注重视觉效果，所身处的每一个场景，人物对话的腔调，丰富的神态表情，每个细节都是游戏中的一部分。美国末日过渡动画更好，实际画面相对较差。

3、人物塑造上，美国末日人物塑造更人性化；神秘海域人物塑造过于脸谱化。

4、游戏性上，神秘海域是兼容了跑酷，刺客信条的攀爬和第三人称射击的游戏，自由度更高，游戏性更强；美国末日自由度相对较低，游戏性相对较差。