1998年撤销怀化地区，改设地级怀化市。截止2017年现辖12个县和一个管委会，包括鹤城区、中方县、洪江市、沅陵县、辰溪县、溆浦县、会同县、麻阳苗族自治县、新晃侗族自治县、芷江侗族自治县、靖州苗族侗族自治县、通道侗族自治县和洪江区管委会。

全市共200个乡、86个镇、11个街道办事处，有275个社区居民委员会和3855个村民委员会。