根据美国于2003年的一项研究，有不少枯干的油井在经过一段时间的弃置以后，仍然可以生产石油，所以石油可能并非生物生成的矿物，而是碳氢化合物在地球内部经过放射线作用之后的产物。

不过，少数科学家认为石油的起源与生物无关。这种看法认为，行星内部天然就存在着大量的碳，一部分以碳氢化合物的形式存在。因为碳氢化合物比岩石轻，逐渐浮向地表，由地底深处存在的微生物将各种碳氢化合物转换排出，曾经一度枯竭的油井经过一段时间的放置，还有可能再次产出原油，这也是现在最有力的看法的佐证。